水运工程设计是四航院的主要业务之一,至今已在国内外完成了千项工程设计。其中包括30万吨级油码头,20~30万吨级矿石、煤码头,10~15万吨级集装箱码头,大型液化石油气(LPG),液化天然气(LNG)码头,跨海铁路轮渡码头及大型防波堤等。